Redacción Farmacosalud.com
Sequentia Biotech, con sede en el Parc Científic de Barcelona (PCB), ha lanzado al mercado la plataforma cloud computing A.I.R. (Artifical Intelligence RNAseq), la primera herramienta de predicción bioinformática que analiza, de forma automática, datos transcriptómicos masivos (es decir, vinculados al ARN o RNA) del genoma de cualquier especie generados por las tecnologías de secuenciación de nueva generación (Next Generation Sequencing, NGS), proporcionando un informe completo en menos de 24 horas.
La transcriptòmica estudia el transcriptoma, el conjunto de moléculas de ácido ribonucleico (ARN o RNA) que existen en una célula, tejido u órgano, y que tienen un papel clave en la regulación de la expresión de los genes y en importantes procesos de la biología celular. Los transcriptomas son muy variables porque proporcionan información sobre todo el conjunto de genes que se están expresando bajo determinadas condiciones en un momento dado y difieren considerablemente de una célula a otra.
El equipo Sequentia
Fuente: Sequentia / Parc Científic de Barcelona
Los transcriptomas pueden ayudar a entender los procesos de carcinogénesis
El desarrollo de las nuevas tecnologías de secuenciación del transcriptoma, como la RNA-Seq, ha permitido avanzar en el conocimiento de la dinámica de la expresión de los genes y en su influencia en el desarrollo de muchos procesos biológicos. Los transcriptomas de las células cancerosas, por ejemplo, pueden ayudar a entender los procesos de carcinogénesis y los de las células madre, el desarrollo y diferenciación celular.
La innovación de A.I.R. radica en que es la primera plataforma de análisis de datos de RNA-Seq del mundo capaz de resolver tres obstáculos importantes en el campo de la genómica: la problemática de la informática (específicamente la de almacenamiento de datos, automatización de resultados, y duración del análisis); la problemática científica generada por las tecnologias de Secuenciación de Nueva Generación (interpretación e integración de datos, además de ofrecer nuevas funciones bioinformáticas y estadísticas); y el problema social (la falta de herramientas sencillas al alcance de los investigadores, que suelen tener pocos conocimientos bioinformáticos).
La nueva era de la transcriptómica
Con el lanzamiento de A.I.R, Sequentia Biotech pone a disposición de la comunidad científica la posibilidad de analizar y comparar, automáticamente, muestras de RNA e interpretar los datos en un mismo programa, de una manera más minuciosa que otros métodos existentes. Pero además, A.I.R. no se limita a organismos modelo, sino que funciona para el genoma secuenciado de cualquier especie, usando actualmente una base de datos de 45.000 genomas. La plataforma utiliza los últimos algoritmos y métodos bioinformáticos publicados, y se actualiza a la vez que éstos. Además es escalable, un número ilimitado de usuarios se pueden conectar sin comprometer la calidad y la rapidez del servicio, y cualquiera de ellos pueden subir sus datos desde su propio G-drive sin necesidad de conectarse a la nube.
“A.I.R. es la primera solución SaaS (Software as a Service) disruptiva porque, además de estar diseñada con métodos científicos robustos, es un software de uso muy rápido y sencillo: sólo se requieren tres pasos y los resultados se pueden obtener en 2 horas e, incluso, dependiendo del tipo y número de muestras, el tiempo se puede reducir a 30 minutos. El coste del análisis con A.I.R. es 50 veces menor que otros métodos equiparables en calidad, y además es automático, sólo hay que subir los datos y definir el genoma de referencia de la especie, es decir, no requiere formación especializada; cualquier investigador que no sea experto en bioinformática la puede utilizar”, explica Walter Sanseverino, cofundador y CEO de Sequentia Biotech.
